桓峰基因——科技改变未来

10x Genomics ATAC测序

ATAC-seq（Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing，染色质易开放区域测序）是2013年由美国Stanford大学的William Greenleaf教授研发了一种全新的方法，利用DNA转座酶结合高通量测序技术，来研究染色体的可进入性。ATAC-seq的原理是，染色质易开放区域测序）利用Tn5转座酶切割染色质的开放区域，并加上测序引物进行高通量测序，通过生物信息分析鉴定转录因子结合位点和核小体区域位置，从而为研究基因调控、DNA 印记等提供有效的方法。通过研究特定状态下开放染色质，可以在DNA水平研究基因转录调控。

传统的寻找全基因组范围内开放的染色质区域采用的方式包括ATAC-seq、MNase-seq和DNase-seq，FAIRE-seq、chip-seq等。10x Genomics Chromium Single Cell ATAC Solution（10x scATAC-seq）是10x Genomics新推出单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略。通过单细胞染色质可接近性图谱构建，不仅能清晰了解染色质结构，还可以绘制高分辨率转录因子调控网络，为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。

技术优势

1. 稀有细胞高效捕：高效捕获稀有类型细胞，实现新突破；

2. 多种样本无挑剔：除常规活细胞悬液外，珍稀液氮速冻样本可实现细胞核水平研究；

3. 测序数据高保真：搭配DNBSEQ™测序系统，不怕单个细胞数据弄混；

4. 自主分析不求人：Dr. Tom交互式单细胞数据挖掘系统支持；

5. 服务模式一站达：流式分选服务服务助力目的细胞分选，一站式实现从组织到细胞数据获取及细胞群验证。

灵敏度细胞分选：高效捕获稀有细胞类型

将两种不同状态的人多功能干细胞（PPSCs以及NPSCs）以99:1的比例混合后，进行DNBelab C系列平台单细胞RNA文库制备和测序，最后鉴定到NPSCs细胞比例为1.3%，表明该平台具备可靠的罕见细胞捕获能力。

可检测单细胞转录调控区域中的开放染色质每个通道可容纳500-10000个细胞核，细胞核捕获率高达65%，运用10x官方软件和工具，可对单细胞基因调控网络进行精细化分析。

技术路线